Slovenský ústav sv. Cyrila a Metoda v Ríme bol založený v roku 1961 z iniciatívy kňazov, ktorí prišli do Ríma študovať po skončení Druhej svetovej vojny, a po udalostiach vo februári 1948 sa nemohli slobodne vrátiť do vlasti, ako aj z generácie kňazov, ktorí po apríli 1950 boli nútení odísť z vlasti, pretože boli doma prenasledovaní pre svoju náboženskú aktivitu. Jeho základný kameň posvätil pápež Ján XXIII. Stavbu posvätil kardinál Eugenio Tisserant 15. septembra 1963 (v roku, keď sa slávilo 1100. výročie príchodu sv. Cyrila a Metoda na Veľkú Moravu).
Dôležitú úlohu najmä v druhej polovici totality, v rokoch 1968 až 1989. V ústave sa formovala slovenská inteligencia a vydávala sa duchovná literatúra, ktorá bola v komunistickom Československu zakázaná. Knihy sa na Slovensko pašovali rôznymi spôsobmi a putovali z ruky do ruky až do úplného zodratia. V roku 1981 ústav navštívil vtedajší pápež Ján Pavol II., ktorý ho v roku 1998 povýšil Slovenský ústav na Pápežský slovenský ústav a zriadil v ňom Pápežské slovenské kolégium svätého Cyrila a Metoda, čím ocenil jeho doterajšiu prácu.
